La Región del Atlántico o Caribe, sobre la base de los conocimientos existentes, se estima que entre el 70 y el 80% de las especies vegetales y animales del país están presentes en los ecosistemas tropicales húmedos, que cubren esta región. Además de los pinares y las especies locales, existen importantes zonas de refugio para las aves migratorias, que constituyen un componente importante de la fauna cuya conservación es una responsabilidad que compartimos con otros países. Muchas de las especies amenazadas o en peligro de extinción, a nivel nacional y en Centroamérica, tienen su mayor población estimada en los ecosistemas naturales de la región del Caribe.

La región está formada por una extensa llanura que desciende paulatinamente desde la Meseta Central hasta las costas del Caribe; con el cerro Wawashan de 554 msnm, la cual se prolonga bajo las aguas del Mar Caribe, formando la plataforma continental de Nicaragua.  Está comprendida entre el curso inferior del río Coco (Segovia o Wangki), el escudo central montañoso, el límite de cuenca del río San Juan y el litoral Caribe.  En esta región se encuentran los ríos más grandes y caudalosos de Nicaragua, que vierten sus aguas en el Mar Caribe como son el Coco (Segovia o Wangki), el Wawa, el Kukalaya, el Prinzapolka, el Bambana, el Grande de Matagalpa, el Kurinwas, el Escondido, el Punta Gorda y el Indio o Maíz.  Esta llanura está sujeta a extensas inundaciones, cerca del litoral hay amplios pantanos, deltas y lagunas costeras.

En la Plataforma Continental de Nicaragua en el Mar Caribe se encuentran una serie de islas, cayos, bancos, arrecifes, entre otras la isla de San Andrés, isla del Maíz Grande (Great Corn Island), isla del Maíz Pequeña (Little Corn Island), Bancos Rosalinda, Media Luna, Serrana, Serranilla, Roncador, Quitasueño y Cayos Miskitos y Perlas.   En todos ellos se localiza la zona económica más importante de Nicaragua.

En esta Región se encuentran 23 áreas protegidas, con una extensión aproximada de 1, 872,066 hectáreas que representan el 84.7% del territorio. Las categorías que se encuentran en estas áreas son: Reserva Biológica (1), Reserva Natural (7) y Reserva de Biósfera (2).